黑龍江省醫(yī)院是1954年于原松江省與黑龍江省合并后，在原兩所醫(yī)院的基礎上組建起來的一所綜合性省級醫(yī)院。1988年日本全國自治體病院協(xié)議會無償提供部分醫(yī)療設備，上級批準進行裝修擴建，使醫(yī)院的醫(yī)療技術基礎得以加強。為紀念中日友誼，經省政府批準，稱黑龍江省醫(yī)院暨黑龍江省中日友誼醫(yī)院。2002年成為哈爾濱醫(yī)科大學第六臨床醫(yī)學院。
黑龍江省醫(yī)院占地面積4萬平方米，總建筑面積達15萬平方米，其中醫(yī)療用房12萬余平方米。病床1200張，醫(yī)療設備總值1.9億元，50萬元以上大型設備39臺（件）。工作人員1835人，衛(wèi)生技術人員1341人，主任醫(yī)師171人，副高職人員323人，各級護理人員717人，享受省政府特殊津貼20人。年門診量70萬人次，年收治住院病人30000人次。醫(yī)院設一個住院部、一座分院和附屬消化病醫(yī)院、兩個門診部；一所附屬護校；四個掛靠研究所設在我院，即黑龍江省老年醫(yī)學研究所、黑龍江省燒傷研究所、黑龍江省消化病研究所、黑龍江省臨床藥學研究所。住院部設有32個臨床科室，14個醫(yī)技科室，10個教研室。同時設有腫瘤放射治療中心，準分子激光近視眼治療中心，急診急救中心，放射免疫檢驗中心，整形美容中心，介入治療中心，脊柱激光治療中心、黑龍江省——美國思達心臟中心。
黑龍江省醫(yī)院位于市區(qū)繁華地帶的南崗分院和附屬消化病醫(yī)院融門診、住院于一體，其建筑雄偉，具有先進的醫(yī)療設施，環(huán)境優(yōu)雅，設備一流?，F設床位324張。設有皮膚性病中心和影像中心、眼病治療中心、急診急救中心、腔鏡中心、整形美容中心、口腔治療中心。
黑龍江省醫(yī)院的消化病院、膚科、燒傷科、心血管內科四個科室被列為省級重點?？?，眼科等12個臨床科室被列為省衛(wèi)生廳重點?？?。附屬消化病醫(yī)院開展的經皮經肝膽囊碎石術、液電碎石治療膽囊結石、肝內結石，支架治療重癥幽門食道梗阻、膽道梗阻等介入治療技術處于國內領先水平。在膽、胰病及門脈高壓合并癥診治方面填補了一些國內及省內空白。心血管內科開展的經皮冠狀動脈成形術治療急性大面積心肌梗塞（急診PTCA）例數和成功率居省內第一。心血管外科開展的冠狀動脈搭橋術93%是在非體外循環(huán)心臟正常跳動下完成的，例數和成功率居省內領先水平。2000年開展的在局麻下非體外循環(huán)心臟不停跳微創(chuàng)左胸小切口冠狀動脈搭橋術為世界第四例手術。開展的右腋下小切口冠心病直視手術為全省之最。利用介入封堵術非手術療法治療先心病獲得成功，填補省內空白。周圍血管病科開展的血管內超聲消融治療慢性深靜脈血栓、超聲消融治療下肢動脈硬化閉塞癥、脛骨鉆孔血管再生術均獲得成功，并開展自體骨髓移植血管再生治療下肢缺血性疾病、微創(chuàng)方法治療慢性深靜脈血栓形成等填補國內空白的兩項新技術，不斷擴大新技術優(yōu)勢，占據新技術前沿。
皮膚病理和大面積燒傷、呼吸道燒傷的總體治療具有較高水平。微創(chuàng)外科方面，應用膝關節(jié)鏡治療關節(jié)內病變；應用經皮激光椎間盤減壓術（PLDD）新方法治療頸椎病、腰間盤突出癥；應用腹腔鏡開展膽囊、卵巢囊腫、輸卵管、子宮切除術。臟器移植正在起步，腎臟移植、肝移植常規(guī)開展，心臟移植處于前期準備階段。放免檢查項目達百余項。
結合臨床需要開展醫(yī)療新技術600余項，承擔省級以上科研課題326項，獲省級科研成果241項，省衛(wèi)生廳科技進步獎118項。舉辦心血管病、周圍血管病等特色技術的國際、國內學術會議200余次。
改革開放以來，醫(yī)院不斷加強與國內外同行間的醫(yī)學友好交流往來關系。醫(yī)院與日本全國自治體病院協(xié)議會交往密切。先后與日本國市立礪波綜合病院、新瀉縣癌中心病院、韓國釜山日新基督病院建立了醫(yī)學友好關系。與新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院建立了學術交流合作關系，并與遼寧、吉林、河北三省省醫(yī)院、內蒙古自治區(qū)醫(yī)院、內蒙古醫(yī)學院附屬醫(yī)院建立了院際交流合作關系。并派出300余人出國研修、考察、參加學術會議、講學。接待來院參觀訪問、學術交流的中外專家、學者等千余人。
1958年醫(yī)院被評為全省文教群英會先進集體，1960年全國文教群英會先進集體，1991年被評為全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體，1992年被評為三級甲等醫(yī)院，1993年被評為省直文明標兵單位、愛嬰醫(yī)院，1994年被評為“創(chuàng)百所信得過醫(yī)院，爭做最佳醫(yī)務人員”活動優(yōu)勝單位，1997年被評為全省衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體。1998年被評為全國“百佳醫(yī)院”，全國“抗洪防病”先進集體，1999年被評為全省衛(wèi)生系統(tǒng)先進單位、省級文明單位。2003年被評為全國抗“非典”先進集體。
醫(yī)院堅持以人為本、 “以病人為中心”的辦院宗旨，以一流的技術、服務、設備、管理，竭誠為保障全省人民的健康貢獻力量。...
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