中山醫(yī)院消化科由著名內(nèi)科學(xué)家林兆耆教授于1953年創(chuàng)立，1978年正式建科，朱無難教授任首任主任。1983－1999年，劉厚鈺教授任主任；1999－2009年，王吉耀教授任主任。2009年至今，沈錫中教授任主任。中山醫(yī)院消化科是衛(wèi)生部?？漆t(yī)師培訓(xùn)基地、國家藥品監(jiān)督管理局中山醫(yī)院臨床藥理基地單位、內(nèi)科博士點和博士后流動站，2010年獲衛(wèi)生部首批臨床重點?？平ㄔO(shè)項目。 目前中山醫(yī)院消化科設(shè)有兩個獨立的病區(qū)，共有核定床位106張，2012年出院人數(shù)達(dá)4100人次。住院病人多為來自全國各地的疑難重危病人，臨床綜合實力強(qiáng)，診治水平高。專科門診每周6天，由副教授和主治醫(yī)師輪流坐診；每周6天均開設(shè)專家門診。2012年門診人數(shù)已逾20萬人次，其中專家門診逾6萬。同時設(shè)有慢性肝病、內(nèi)鏡治療、腸道疾病、胃食管反流等專病及特色門診。在慢性肝病診治、肝纖維化機(jī)制、內(nèi)鏡治療等領(lǐng)域的研究水平名列全國前茅，承擔(dān)多項國家自然科學(xué)基金研究課題、上海市科委和863課題。研究成果 “肝纖維化細(xì)胞分子機(jī)制與治療策略”獲上海醫(yī)學(xué)科技一等獎及中華醫(yī)學(xué)科技三等獎（第一完成單位）（2008）、“消化道腫瘤及慢性肝病靶向納米藥物載體研制”獲上海科技進(jìn)步二等獎及教育部科技進(jìn)步二等獎（第一完成單位）（2007）。 經(jīng)過數(shù)十年的發(fā)展和積累，復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院消化科的技術(shù)力量雄厚，形成了一支全面掌握消化科診療核心技術(shù)的強(qiáng)大的學(xué)術(shù)隊伍。目前消化科共有醫(yī)師31名（不包括在大內(nèi)科進(jìn)行規(guī)范化培訓(xùn)的住院醫(yī)師），包括正高5名、副高10名、主治醫(yī)師14名、完成規(guī)范化培訓(xùn)的住院醫(yī)師2名。其中獲博士學(xué)位20人，碩士學(xué)位9人，學(xué)士學(xué)位2人。本學(xué)科十分重視人才培養(yǎng)和學(xué)科建設(shè)，鼓勵年輕醫(yī)護(hù)人員出國進(jìn)修或在職攻讀學(xué)位。主要青年主治醫(yī)師大都曾出國進(jìn)修，赴美國、德國、瑞典、法國、香港等地學(xué)習(xí)肝病、內(nèi)鏡治療、腹腔鏡等科研和臨床技能，學(xué)成回國后均能獨立開展相應(yīng)的科研和臨床新技術(shù)應(yīng)用工作。目前已形成一支包括4名博士研究生導(dǎo)師在內(nèi)的老中青結(jié)合，以中青年為主，梯次合理的，在醫(yī)、教、研各方面均有一定能力的不同層次的穩(wěn)定的人才隊伍。

在慢性肝病診治、肝纖維化機(jī)制、內(nèi)鏡治療等領(lǐng)域的研究水平名列全國前茅，承擔(dān)多項國家自然科學(xué)基金研究課題、上海市科委和863課題。